Archive for the ‘Research’ Category

Bukan Ngoding Biasa…

Berawal dari chat dengan adek kelas saya saat kuliah di UGM
x : Mb afia, kalau skripsi tuh harus ngoding ya?
afia : Hmm, maksudnya?
x : Aku belum bisa ngoding mb, padahal semester depan ambil skripsi…
afia : Yaa…nyoba - nyoba koding lah mulai sekarang, bisa - bisa, anak ilkomp gitu loh…
x : Mb afia, ajarin aku ya?
afia [...]


Defense???

Kemaren, senpai saya, PhD student di lab menjalani sidang disertasi. Sebelum sidang, hari Jum’at pekan sebelumnya, senpai mempresentasikan disertasinya di depan lab member. Senpai saya menyelesaikan PhD nya dalam waktu 2.5 tahun. Proses administrasi untuk submit disertasi memerlukan waktu 6 bulan dan syarat dari universitas untuk submit disertasi harus melampirkan bukti 2 paper yang accepted [...]


Who is the 1st programmer in the world?

Who is the 1st programmer in the world? Of course not me ^_^
A female mathematician, Augusta Ada King, Countess of Lovelace (known as Ada Lovelace) is considered as the 1st programmer in the world. She is a wife of an English nobleman and scientist, William King-Noel, 1st Earl of Lovelace.

Ada Lovelace, image is taken from [...]


Seandainya nama saya Afika…

Dialog yang biasanya terjadi antara saya dengan senpai di lab (Postdoc)
senpai : afia-san…
afia : haik…
senpai : there is a new method.
afia : hmm…nanka?
senpai : you can check in the paper written by x in y journal this month
afia : ohh ok…
In the other site
temannya afika : afika….
afika : apa???
temannya afika : ada yang baru [...]


Naive code to calculate N50 in Perl

A critical stage in genome sequencing is the assembly of shotgun reads, or piecing together fragments randomly extracted from the sample, to form a set of contiguous sequences (contigs) representing the DNA in the sample [1]. N50 is one of the quality parametres of genome assembly. N50 indicates the scaffold/contigs length such that 50% of [...]


Ohh…can’t sleep…

Finally can’t sleep… >